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MR600D超声仪打断基因组DNA实验(振幅20%)

该实验记录围绕MR600D超声仪打断基因组DNA实验(振幅20%),展示超声打断条件、样品处理和片段检测结果,为DNA片段化参数优化提供参考。

MR600D****超声仪打断基因组DNA实验(振幅20%)


实验日期: 2026年1月16日

实验时间: 14:00

**实验目的:**在相同超声条件下,测试同批次DNA片段化差异。

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实验设备与材料:

超声破碎仪型号: MR600D

样本管: Axygen品牌低吸附离心管,货号(MCT-060-L-C)

实验温度: 4℃

• **实验材料: **新鲜全血基因组DNA

一、 实验设置

本次实验设置了两个样本(B0001 和 B0005),并在特定的超声条件下进行处理。

超声条件:

振幅: 20%

循环模式 (On/Off): 15秒超声 / 15秒暂停

◦ **总时间设置:**3600s(1800s+1800s)

中途离心: 在1800s时进行一次离心,减少样品飞溅在管壁上影响超声。

中途不取样:所有样品待超声结束后统一取样送检

样本信息:

样本 B0001:

原始浓度: 106 ng/μL

原始体积: 60 μL

总质量: 6.36 μg

样本 B0005:

原始浓度: 98 ng/μL

原始体积: 60 μL

总质量: 5.88 μg

二、 样本配制

将原始样本稀释至目标浓度和体积。

项目

样本 B0001

样本 B0005

原始浓度

106 ng/μL

98 ng/μL

取样体积

60 μL

60 μL

加TE总体积

550 μL

550 μL

超声样品浓度

10 ng/μL (≈10.6 ng/μL)

10 ng/μL (≈9.8 ng/μL)

分装体积

100 μL/支,共6支

编号1-6

100 μL/支,共6支

编号7-12


三、 超声打断与取样记录

对两个样本进行超声处理,在两个1800s超声程序结束后,对1-12支样品管各取样10ul进行片段检测。

设定总时间

超声时间

**样本 B0001 **

**样本 B0005 **

备注

1800s

15 min

1-6

7-12

混匀离心后再超声

1800s

30 min

1-6

7-12

结束后统一取样送检


四、 备注

• 由于移液误差,最后加注6号和12号样本管时,样本体积不足100ul,实际样品体积均为65μL左右。

五、 质检概要

详细检测报告可在“技术服务**-下载文件”中查看对应标题PDF****文件**


五、 实验结论

**新鲜全血基因组DNA样品打断测试,**全部样本打断结果片段大小一致,峰值都在200bp内。

峰值没有精确到个位数原因:超声打断时样品飞溅到管壁上,没有得到更有效超声,导致峰值差异。

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