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MR600D超声仪打断基因组DNA时间梯度测试(1.5ml Axygen离心管)

该实验记录围绕MR600D超声仪打断基因组DNA时间梯度测试(1.5ml Axygen离心管),展示超声打断条件、样品处理和片段检测结果,为DNA片段化参数优化提供参考。

实验报告:MR600D超声仪打断基因组DNA(再次使用1.5mL样品管架)

实验日期:2026年3月22日

实验目的:前期的基因组DNA打断测试用的都是0.5mL样品管架搭配100uL体系,这次重复上次测试(2026-3-19)使用1.5mL样品管架搭配 Axygen 品牌1.5mL低吸附离心管(货号MCT-150-L-C)探究超声打断效果。


二、实验材料与设备

  1.   **实验材料**:新鲜全血基因组DNA样品(浓度132ng/uL)、TE缓冲液、纯水。
    
  2.   **实验耗材**:Axygen 1.5mL离心管(型号MCT-150-L-C)
    
  3.   **实验设备**:非接触式超声波破碎仪(型号MR600D)
    
  4.   **超声条件**:
    

功率:20%振幅。

循环:15秒开/15秒关 (15/15s)。

每一轮总时长设置:600秒。

检测:在每轮超声结束时各取6μL样品。

  1.   **冷水机:**Huber品牌冷水循环机,默认预冷4℃。
    

三、实验步骤

  1.   **样品准备**:取40μL原样品(132ng/μL),加入1×TE缓冲液560μL,混合后分装至两管,每管300μL,标记为A样和B样,终浓度约为8.8ng/μL。
    
  2.   **超声处理**:
    

超声条件:20%振幅,实际功率210W,冷水机维持4℃水浴低温循环水环境。

取样安排:每一轮总时间设置600秒(超声时间即300秒)结束后,A、B管各取样6μL,共进行5轮取样(超声总时间1500秒即25min)。


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四、实验流程

超声总时间

A****样

B****样

300s

取样6μL 编号①

取样6μL编号②

600s

取样6μL 编号③

取样6μL 编号④

900s

取样6μL 编号⑤

取样6μL 编号⑥

1200s

取样6μL 编号⑦

取样6μL 编号⑧

1500s

取样6μL 编号⑨

取样6μL 编号⑩

注:上次测试(2026-3-19)结束后大①号和大②号各余留275ul,换管后分别补25ul的1×TE缓冲液,借这次实验加超1800s,总计超声总时间是30min。取样编号为11和12,同上面10个样品一同送检。


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详细检测报告可在“技术服务-下载文件”中查看下载对应标题PDF文件

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五、结果分析

  1.   **同次超声处理完全能保障批次内的重复性**:在相同的超声时间内,A样B样除了操作误差导致浓度不一致,片段峰值无明显差异!
    
  2.   **体积变化与取样一致性**:每轮取样6μL,总体积控制稳定,终浓度计算准确,确保实验结果的可比性。
    
  3.   **设备参数稳定性**:超声仪功率(210W)及冷水机温度维持稳定,排除设备波动对实验结果的干扰。
    

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六、结论

MR600D非接触式超声波破碎仪的稳定性得到明确的验证,无论批内批间差异均不明显,超声效率上和进口相比是慢了些,但是实验关键最在乎的的稳定性重复性可再现性。慢些也有好处,获取不同大小峰值片段的时间窗口足够长,保证了容易获取。太快的话目标片段稍纵即更短-不易获取。