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徐钛二号超声仪原型机-DNA打断测试(振幅20%)

该实验记录围绕徐钛二号超声仪原型机-DNA打断测试(振幅20%),展示超声打断条件、样品处理和片段检测结果,为DNA片段化参数优化提供参考。

徐钛二号超声仪原型机-DNA打断测试

实验基本信息

日期: 2025年12月6日

项目: 徐钛二号超声仪原型机-DNA打断测试

目的: 利用徐钛二号超声仪原型机打断基因组DNA,测试不同超声时间下的片段化效果,并分析样本浓度对超声效果的影响力。

设备: 徐钛二号超声仪原型机(黑金刚一号)

样本信息

项目

样本A(A00132 B1D1)

样本B(A0021 B1D1)

原始浓度

49.6 ng/μL

133.0 ng/μL

原始体积

≈80 μL

≈80 μL

目标浓度

20 ng/μL

40 ng/μL

目标体积

120μL

120μL

取样量

48 μL 原液

36 μL 原液

补加1×TE

72 μL

84 μL


超声打断条件与取样记录

总超声时间: 60分钟

• 超声振幅:20%

• 超声15s/暂停15s

取样方案: 在不同超声时间结束后从样本中取样5μL。

超声时间

样本A (A00132) 取样编号

样本B (A0021) 取样编号

5 min

1

2

10 min

3

4

20 min

5

6

30 min

7

8

60 min

9

10

120mim

11

12


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详细检测报告可在“技术服务**-下载文件”中查看下载对应标题PDF****文件**

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试验结论

超声5分钟时,DNA片段长度可被打断至600bp峰值

超声10分钟时,DNA片段长度可被打断至500bp峰值

超声20分钟时,DNA片段长度可被打断至250bp峰值

超声30分钟时,DNA片段长度可被打断至200bp峰值

超声60分钟时,DNA片段长度可被打断至150bp峰值

超声120分钟时,DNA片段长度可被打断至120bp峰值

两样品浓度相差一倍,从检测报告来看,浓度大的片段化稍稍有滞后,几乎无差别,推测40ng/ul浓度几乎不影响超声打断。

超声打断速度相比于进口品牌,例如Bioruptor pico、M220/S220等慢了些,与Q800相仿。

超声时间与片段大小呈现稳定的线性关系,有助于实验的稳定性和可重复性!